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孙思邈纪念馆位于药王山文化景区山门以西，处于景区东西轴线核心位置，作为景区标志性建筑，是药王孙思邈中医药文化传承展示的重要窗口和中国孙思邈中医药文化节的重要举办地。

孙思邈纪念馆总占地面积45亩，总建筑面积15300平方米，其中展厅面积7700平方米，主要展览药王孙思邈的生平事迹、医药著作、学术贡献及我国中医药文化发展历程。

孙思邈纪念馆(药王山博物馆)基本陈列是以金、元、明、清古建为主体的古建筑群，以北魏《姚伯多兄弟造像碑》为首的珍贵碑石陈列和展示佛教文化艺术的宝贵遗存摩崖造像，以及展示元代《朝元图》的地面宫殿式壁画等文物。其中药王山摩崖造像开凿于隋唐时期，现存大小佛龛23个，造像45尊，12处题记和两通碑石。碑林收藏着历代珍贵碑石，尤以北魏的《姚伯多兄弟造像碑》、《魏文朗造像碑》等最为著名。总体布局采取唐代建筑群落前阙后殿的格局，并充分运用多种展陈方式，将药王孙思邈的“大医精诚”和中医药文化进行专属性、显著性的建构与展示，打造经得起历史检验的精品文化工程。